• 数据利用度高:利用少量的数据即可高深度覆盖人MHC相关区域,针对性强;
• 覆盖度高:捕获区域大,目标区域的覆盖度≥97%;
• 可分型数目多:可以对MHC区域的26个基因进行分型;
• 分型准确率高:分型准确率达到95%以上。
可结合客户的需求,协商确定生物信息分析内容包括SNP最好的网赌软件,注释和统计; InDel最好的网赌软件,注释和统计;
HLA分型;SNP,InDel与疾病的关联分析;
HLA型别与疾病的关联分析等,以及客户提出的个性化生物信息分析要求。
一 .样本要求
• 样品总量:≥ 3 μg DNA;
• 样品浓度:≥ 37.5 ng/μL;
• 样品纯度:OD260/280=1.8-2.0。
二 . 测序策略:90 PE。
三. 推荐数据量:测序深度 > 80X。
四. 项目执行周期间
按标准流程(不包括高级信息分析),100个样本(平均深度80X)的人MHC测序项目
运转周期约为50个工作日。
五. 项目合格指标:有效平均测序深度不低于合同的规定。