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环形RNA测序

技术优势
服务内容
服务说明
个性化生物信息分析

circRNA测序—研究circRNA的差异表达如何影响生物学过程

环状RNA（circular RNA, circRNA）是一类特殊的非编码RNA分析，测序采用Illumina测序平台进行测序，针对有参考基因组样本开展准确的circRNA鉴定以及来源基因的分析，环状RNA测序在医学、农学研究领域应用越来越广泛。

高效：定量准确、检出率高：
基于高通量测序，依据主流数据库和circRNA鉴定软件，分析项目物种的circRNA信息，深入挖掘circRNA在转录调控中所发挥的
重要功能。

应用方向

circRNA测序适合生命体生长发育等各个阶段、部位或方面的研究。

生长发育
人、小鼠、果蝇等细胞、组织生长发育研究。
癌症疾病
肿瘤、代谢病、免疫病等疾病发生与诊治研究。
植物
植物胁迫、生长发育、遗传育种等研究。

信息分析

circRNA测序项目，标准分析流程：主要包括质控，比对，拼接，鉴定，筛选，定量，差异分析，富集分析，miRNA结合位点分析，组织特异性分析，编码潜能预测等等环节。该分析的核心是circRNA 可以通过与 miRNA 结合的方式抑制 miRNA 的功能。因此，对鉴定的 circRNA进行 miRNA 结合位点分析，有助于进一步研究 circRNA 的功能。

关联分析

1.circRNA与miRNA关联分析

circRNA通过与miRNA结合的方式抑制miRNA的功能。通过生信软件分析预测circRNA和miRNA的靶向关系。

2.circRNA、miRNA与mRNA关联分析

circRNA具有miRNA结合位点，可以作为miRNAspong竞争性地结合miRNA, 抑制miRNA对靶基因的调节作用，从而间接地调控基因表达。基于ceRNA理论，筛选拥有相同miRNA结合位点的circRNA-靶基因对，构建以circRNA为decoy、miRNA为核心、mRNA为靶标的circRNA-miRNA- mRNA调控关系，构建ceRNA调控网络。