• 高密度、高覆盖度:获得贯穿整个基因组的高密度分子标记;
• 精确度高:采用DISR生物信息分析流程,保证SNP的高准确性;
• 性价比高:基于酶切简化的基因组DNA,数据量低,特别适合大样本量研究;
• 快速高效:只需3-4个月即可完成大样本的图谱构建或群体进化研究。
一、测序数据基本分析
• RAD tag 产出数据统计;
• 对于无参考基因组的物种,进行个体 RAD tag 聚类与群体 RAD tag 聚类;
• 对于有参考基因组的物种,与参考基因组进行比对;
• SNP最好的网赌软件、注释及统计;
二、个性化生物信息分析——遗传图谱构建;
• 基因分型;
• 遗传图谱构建;
• QTL 定位(需提供表型数据);
• 遗传图谱整合(需提供同一作图群体原图谱数据);
• 高级信息分析——群体进化研究;
• 群体进化树分析(Phylogeny tree);
• 群体结构分析(Structure);
• 群体主要成分分析(PCA);
• 连锁不平衡分析(LD)。
可结合客户的需求,协商确定信息分析服务内容。
一、样本要求
样品类型:DNA样品,无降解或轻微降解,无污染;
样品需求量(单次):≥ 1 μg(单次),如果需要多次制备样品,则需要样品总量=制备样品次 数×1 μg;
样品浓度:≥ 25 ng/μL;
群体分析材料选择推荐:物种内亚群的划分要比较明确,相同亚群内的个体要有一定的代表性,选择材料将
影响到群体选择分析的结果;
构建遗传图谱推荐100个样本以上。
二、项目运转周期
标准流程的运转周期约为60个工作日。
三、项目合格指标
产生不低于合同规定的clean data。