• 技术稳定,建库重复性好:同一样本重复建库相关性Pearson值大于0.993;
• 基于高通量测序技术,可一次性获得样本中几乎全部的lncRNA信息;
• 不局限于对已知lncRNA的研究,还可进行novel lncRNA的预测;
结合客户的需求,协商定制其它定制化信息分析内容,包括转录本组装;
鉴定已知lncRNA; 鉴定蛋白编码序列; 预测新的lncRNA; lncRNA家族预测分类;
lncRNA定量及差异分析,CNC(coding-non-coding)共表达注释;
Pathway富集分析,以及客户提出的个性化生物信息要求。
一、样品要求
表1 样品质量判定标准
样品类型 | 最好的网赌软件方法 | 最好的网赌软件结果 | 判定结论 | |||
Agilent/AGE | NanoDropTM | |||||
人、鼠Total RNA | Agilent | m≥10 μg | c≥200 ng/μL | 图谱基线无上抬, | N/A | Level A |
5 μg≤m≤10 μg | Level B |
说明:
Level A:A类样品,指的是质量满足建库测序要求,且总量可以满足2次或者2次以上建库需要的样品。
Level B:B类样品,指的是质量满足建库测序要求,且总量可以满足1次但不足2次建库需要的样品。
二、项目运转周期
标准流程的运转周期约为50个工作日(20对样本以上需额外增加时间)。
三、项目合格指标
产生不低于合同规定的clean data。